CBD może wpływać na metabolizm leków w organizmie, zwłaszcza tych rozkładanych przez enzymy cytochromu P450 (m.in. CYP3A4). Może to skutkować zwiększonym stężeniem niektórych leków we krwi lub zmniejszoną skutecznością innych. Dotyczy to m.in. leków na serce, tarczycę, przeciwpadaczkowych czy rozrzedzających krew. Suplementacja CBD powinna zawsze być skonsultowana z lekarzem – zwłaszcza przy stosowaniu leków z tzw. ostrzeżeniem grejpfrutowym.